在實驗室純水器的日常使用過程中，一些因素會導致其水質受到影響，那么較常見的就是因為設備長時間的擱置不使用導致的水質受影響了。如果實驗室純水器長久停機再次啟用這些污染物肯定要被帶入過濾裝置，雖然說反滲透膜可以去除百分之九十以上的雜質，但是還是會有一小部分的雜質會進入下一級。還有離子交換樹脂長時間不用也會被微生物污染，因為儀器一旦長久不用樹脂將是微生物的培養基，這樣的話一旦取用超純水，污染雜質流出，超純水達不到分析測試的要求，會干擾實驗數據，會給客戶帶來一些不必要的麻煩。
　　實驗室純水器在放假期間會停運，為了長時間停用的實驗室超純水機能正常運行，我們要采取一些維護措施：
　　1、首先要清洗反滲透系統中的膜元件;
　　2、用反滲透產出的水質配制殺菌液，并用殺菌液沖洗反滲透系統;
　　3、用殺菌液充滿反滲透系統后，關閉相關閥門使殺菌液保留于系統中，此時應確認系統充滿;
　　4、如果系統溫度低于27℃，應每隔一個月用新的殺菌液進行前兩個步驟，如果系統溫度高于27℃，則應每隔半個月更換一次殺菌液;
　　5、在單級反滲透純水機系統重新投入使用前，用低壓給水沖洗系統一小時，然后再用高壓給水沖洗系統5分鐘，無論低壓沖洗還是高壓沖洗時，系統的產水排放閥均應全部打開。在恢復系統正常操作之前，要檢查并確認產品的水中不含任何殺菌劑。